关键词:COVID;突变株;监测
1,新冠疫情主流毒株为HV.1及家族毒株
在全球普遍放开的情况下,新冠的主流毒株也越来越趋向一致。美国和英国尽管也已经取消了全面监测,但仍有持续的数据更新,故对其他国家仍有借鉴意义。
2023年10月27日,美国疾控中心(CDC)更新了美国COVID-19疫情主流毒株的最新变化【1】,显示(比例增加的毒株标记成了红色):
XBB.1.9.2的子代EG.5检出比例达到了21.9%,EG.5的子代HV.1占25.2%;XBB.1.9.1的子代FL.1.5.1检出比例为12.0%;这三个毒株也是美国最常检出的毒株。EG.5还有另一个子代HK.3占7.5%,由此XBB.1.9家族合计占检出毒株超过66.9%。
XBB.1.16检出比例为2.2%,其子代XBB.1.16.6占9.2%、XBB.1.16.11占3.1%、XBB.1.16.15占1.5%、HF.1占1.8%;由此XBB.1.16家族合计占检出毒株超过17.8%。
XBB.2.3比例为3.0%,其子代GE.1.1占1.8%。
总体来说,HV.1及其家族构成了主流毒株,美国的本次报告仍未见BA.2.86的报告(但英国已占2.1%)。
(2023年10月27日更新的美国新冠主流毒株变化。图源:美国CDC)检测指标中最早反映疫情变化的是废水中新冠病毒浓度和新冠检测阳性率,这两项指标都显示,美国新冠疫情趋于平稳。根据美国废水中新冠病毒监测网站更新到10月23日的数据【2】,从六月底开始持续增高的美国废水新冠病毒浓度在8月底达到最近半年的高峰640拷贝数/mL,目前已降低到384拷贝数/mL。
与此同时,美国CDC更新到10月21日的数据显示,最近6周美国新冠病毒检出率持续增高(橙线所示),最近一周检出阳性率为8.7%,较之前一周降低了0.7%【3】。
(美国新冠住院(蓝色柱状图)和检出阳性率(橙线)变化。图源:美国CDC)根据美国CDC截止到10月21日的数据,美国因新冠去急诊就诊的病例数(橙线)较一周前降低了4.6%;截止到10月21日的数据显示,因新冠感染而住院的人数(蓝色柱状图)较过去一周降低了0.2%【4】。4,曹云龙:警惕XBB.1.5家族,但更需要监控BA.2.86家族
2023年10月18日,曹云龙在推特(马斯克已改名为X)更新了其团队对于最新突变株的中和活性和毒株与ACE2结合力的研究结果【5】,显示:1)与XBB.1.5相比,其家族后代HV.1,JD.1.1的免疫逃逸更为明显;但都比不过BA.2.86的后代JN.1。2)JN.1不仅免疫逃逸更明显,而且其与ACE2的结合力也更强、意味着入侵到人体的感染力更强;回顾最近3个月的新冠疫情,BA.2.86让大家失望了;但BA.2.86没有掀起的风浪,很可能会有其子代JN.1完成。建议老年人及免疫功能低下的人群及时接种更新的疫苗;一旦确诊,及时口服抗病毒药物预防重症。
我们会继续保持关注,提供最新的新冠相关科学报告和数据。【1】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions【2】 https://biobot.io/data/【3】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#maps_positivity-week【4】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#maps_new-admissions-rate-county【5】 https://twitter.com/yunlong_cao本文只是分享和解读公开的研究论文及其发现,以作科学文献记录和科研启发用;并不代表作者或本公众号的观点。为了给大家提供一个完整而客观的信息视角,我们有时会分享有冲突或不同的研究结果。请大家理解,随着对疾病的研究不断深入,新的证据有可能修改或推翻之前的结论。
编辑:Henry,微信号:Healsan;加好友请注明理由。助理:ChatGPT作者简介:美国Healsan Consulting(恒祥咨询),专长于Healsan医学大数据分析、及基于大数据的Hanson临床科研支持。主要为医院科研处、生物制药公司和医生科学家提供分析和报告,成为诸多机构的“临床科研外挂”。点击👆;From Bench to Bedside, Healsan Paves the Path.(点击👆图片,进入自己感兴趣的专辑。或获得点击“资源”,浏览本公众号所有资源。)