二代测序已出圈!从《外科风云》到《谢谢你医生》的感染诊断演进
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电视剧中经常有一些被观众吐槽的医学常识性问题。比如穿白大褂不扣扣子,白衣飘飘以为自己很帅;挂个听诊器在脖子上,不管是妇产科还是泌尿科;医生护士为了展示自己美丽的容颜,口罩随时随地可摘下;碰到有人溺水,也不检查有没有心跳直接就上人工呼吸……
吐槽归吐槽,值得肯定的地方尹哥也要肯定下。就说近期热播的电视剧《谢谢你医生》中,有这样一段故事:一名在家晕倒并伴有高热的妇女被送入急诊重症监护室(EICU),随时可能心脏骤停,情况万分紧急,然而主治医生试了很多方法后,却迟迟找不出病因。就在这时,医生提出,将患者血液标本送去做二代测序,并由此检测出大肠埃希菌、人类疱疹病毒。病因查明后,医生就能更具针对性地进行治疗,最终患者的生命体征得以恢复。
△《谢谢你医生》剧情截图
看到这里,尹哥的小伙伴以及很多做基因测序的同行纷纷表示,自己每天做的事情终于以电视剧的形式被观众们知晓了~这对于很多做过和将要做该项检测的病人而言,对宏基因组和病原快检的认可度和信任度可是有了大幅度的提升,可谓是对基因测序的一次很好宣传。
俗话说,中医看病要把脉,西医问疾多检查,不管中医西医,如何精准地找出并把握致病原因,都是对症下药以及最终治疗的关键。现代科技的发展推动着医学的进步,相对于传统医学,基因测序从实验室走进临床,已然成为现代医学求根溯源的主要工具。对于感染类疾病更是如此,如果用传统的方法去辨别致病微生物,大都需要进行染色、培养,并在此基础上进行生物鉴定,才可以区分是病毒、细菌、真菌,还是其他微生物。这样的方法环节太多、操作复杂,更重要的是时间太长。
2017年播出的《外科风云》里就曾讲过一个和致病微生物有关的故事:有数十名病人出现不明原因的高烧,医生怀疑是由于耐药菌感染引起的,但若要查明是哪种细菌,需要9~12天进行检测才能出结果。然而在这场时间与生命的赛跑中,最大的问题就是“等不起”,医院决定联用多种抗生素进行治疗,但有身体虚弱的患者在连续使用五种抗生素后,感染依然未能缓解,最后病危去世。
△《外科风云》剧情截图
其实,从《外科风云》到《谢谢你医生》,也反映了现实生活中感染诊断方式的演进。过去,人们对于病原体的检查形式比较单一,耗时较长,很可能耽误治疗,而《谢谢你医生》里“出圈”的二代测序,就是当下能精准查明病原体的“神兵利器”。随着基因测序技术的飞速发展,基于测序的宏基因组学在耐药菌的鉴定与进化分析、耐药基因谱分析、混合病原菌感染检测等方面展现出广阔的应用前景,还可用于耐药菌暴发疫情的溯源,新型耐药菌的检测等。如若《外科风云》中可以尽早使用这些方法,面对耐药菌,医生也不至于束手无策。
从“无药可救”到“精准把脉”,二代测序的贡献功不可没,然而它到底是什么东西?为什么能精准地测出致病微生物?普通人用得起吗?
这里谈到的二代测序指的是相对于一代测序的新一代高通量基因测序(Next-Generation Sequencing ,NGS)。一代测序主要采用Sanger测序法,虽然经过众多科学家的不断改进,但仍存在通量低、成本高等问题,大多止步于科学研究,很难应用到临床实践中。而以NGS为代表的二代测序,克服了这些缺点,并大大缩短了测序时间,成功打通了从科研到临床的路径。
电视剧的宣传会让更多人了解和认可基因测序技术,但最后决定普通百姓是否用得上、用得起的,还得是价格。以“人类基因组计划”为例,当时绘制一个人类基因组草图,来自英、法、美、日、德、中6国的数百名科学家耗费了13年时间、耗资38亿美元。今天,国外测一个人基因组的价格到600美元,而华大智造拥有自主知识产权的国产测序仪,已经可以将个人全基因组的测序成本降至200美元左右,并在24小时内完成,真正做到了普惠。
△华大智造的国产基因测序仪DNBSEQ-T7,在新冠病毒序列解码中承担重要的工作
今天,测序技术带给我们的,不只感染致病菌筛查,对于肿瘤早筛早诊、预防出生缺陷等方面都具有极为重要的意义。希望未来,以测序为代表的高新技术能更快、更广泛地在临床中应用,真正走进寻常百姓家。
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