Nature | 新冠相关人类遗传结构图谱II公布，一系列科研课题待解决

自新冠爆发以来，全球共报告了6.519亿例新冠肺炎 (COVID-19) 确诊病例，其中 660 万人死亡。研究调查了严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 感染的各个方面及其对人体的影响，以对抗 COVID-19 引起的发病。研究宿主遗传因素在 COVID-19 严重程度和易感性中的作用可以帮助我们了解影响不良结果和药物开发的潜在生物学机制。

近日，发表在《Nature》杂志上的一项题为“A second update on mapping the human genetic architecture of COVID-19”的研究揭示了有关 COVID-19 易感性和严重程度的新遗传学见解。

该研究由 COVID-19 宿主遗传学计划牵头，由赫尔辛基大学的Andrea Ganna 教授领导，代表了来自世界各地专家的非凡合作成果，第二次更新确定了 51 个与 COVID-19 严重程度和 SARS-CoV-2 易感性相关的重要全基因组基因座。

作者提出了来自 COVID-19 宿主基因计划的第二项更新的全基因组关联研究 (GWAS)，该研究涉及 COVID-19 的严重程度和对 SARS-CoV-2 的感染易感性。研究人员对多达 219,692 个病例和超过 300 万个对照进行了荟萃分析，确定了 51 个不同的全基因组重要位点，在之前已有的数据发布中添加了 28 个位点。已识别位点上候选基因数量的增加有助于绘制与易感性和严重程度相关的三个主要生物途径：病毒进入、粘液中的气道防御和I型干扰素。

研究人员对来自 35 个国家的 82 项研究的 3 项表型进行了荟萃分析，其中包括 36 项针对非欧洲血统个体的研究：危重疾病（21,194 例）、住院治疗（49,033 例）和 SARS-CoV-2 感染（219,692 例）。

研究人员分别发现了 30 个、40 个和 21 个与 SARS-CoV-2 引起的危重疾病、住院治疗和感染相关的位点，在所有三种表型中总共有 51 个不同的全基因组显着位点。

使用作者之前开发的两类贝叶斯模型将基因座分类为更有可能参与感染的易感性或严重程度，作者确定了36个基因座显著更可能（高于99%）影响疾病严重程度（住院），9个基因座明显更可能影响严重急性新冠病毒2型感染的易感性，而其余6个基因座则无法分类。

36 个基因座更有可能（高于 99% ）影响疾病严重程度（住院），9 个基因座更有可能（高于 99%）影响疾病严重程度（住院）基因座更可能影响 SARS-CoV-2 感染的易感性，而其余 6 个基因座无法分类。

为了更好地了解 COVID-19 易感性和严重程度的生物学机制，研究人员通过将候选致病基因映射到生物途径并进行全表型关联分析，进一步表征了候选因果基因。总共，51 个位点中的 15 个可能与由专家驱动的分类定义的涉及易感性和严重程度的三个主要途径相关：（1）病毒进入；(2)气道粘液的进入防御；(3) I型干扰素反应。此外，全表型关联分析确定了九个参与健康肺组织维护的基因座。

研究人员使用遗传相关性和孟德尔随机化分析来确定风险因素对 COVID-19 表型的潜在因果影响。总共，14 个新的遗传相关性和 10 个新的稳健暴露-COVID-19 特征对显示了因果关联的证据。

特别是，开始吸烟和每天吸烟的数量与严重程度和易感性表型呈正相关；孟德尔随机化表明吸烟与 COVID-19 风险增加存在因果关系，进一步强调了健康肺组织在 COVID-19 严重程度中的作用。此外，基因检测的较高肾小球滤过率（表明肾功能较好）与较低的 COVID-19 危重病风险相关，而基因预测的慢性肾病与 COVID-19 危重病风险增加相关，这表明更好的肾功能有利于降低 COVID-19 严重程度的风险。

总之，进一步研究这些易感性和严重程度基因座如何映射到不同的途径将为了解 COVID-19 的人类遗传结构提供机制见解。

撰稿：Catherine

小编微信

注：添加小编请备注昵称+单位+研究

生命科学综合交流QQ群:681341860

微信学科群：病毒学群，神经科学群、临床医学、肿瘤学科群、硕博交流群和医药投资交流群（微信群审核要求较高，请各位添加小编后主动备注单位研究方向）