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生信真的卷不动了?这个方向一片蓝海,快冲!

生信真的卷不动了?这个方向一片蓝海,快冲!

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疫情期间,大家都待在宿舍不能动弹,平时总被导师鞭策,早点发高分,早点发高分,早点发高分。


是我不想发吗?是早发晚发的问题吗?不是我不努力,生信发文真的越来越难!发个3分左右的文章已经要了我的老命。



这下因为疫情,去不了实验室,啥也干不成,导师也闭麦了。真好啊~


同门里也有几个卷王早早发了5+的,但我不care。要问我心态为啥这么好,还不是因为有个只能发2分文章的师弟陪着我垫底,我俩常常互相调侃对方为学渣,建立了深厚的革命友谊。


正当我躺在床上享受岁月静好时,突然传来一连串微信提示音。我打开手机一看,师门群里好不热闹。


“恭喜师弟!”“师弟太厉害了吧!”“师弟闷声发大财啊!”


看着看着我人傻了,怪不得师弟最近稳如老狗,原来他发了一篇8.36分文章,原来只有我两手空空在寝室做咸鱼,原来只有我是学渣!



被同门后辈反超,我一下子不淡定了。怎么突然一下子差距拉开这么大?


“师弟,说好一起当低分学渣的呢?”我私聊师弟。


“哈哈哈师兄,我也没想到能发这么高呀,就是看别人说有个方法好使,就找来资料研究了研究,没想到真成了!”


“有好东西怎么不分享分享?”我酸了。


“拿去吧师兄,这份生信+机器学习进阶套路手册真的很顶!”师弟甩给我一份资料。


机器学习?接下来,我仔细研究了一下机器学习以及这份资料,感觉自己摆脱低分崽身份还真的有希望了。


1

PRAT

机器学习+生信=开挂?


仔细研究了2分左右的生信文章,发现它们主要聚焦在差异基因的筛选、功能富集分析、基因表达水平的检验、预后模型的建立和评估等等。


这些都是常规的生信分析思路,创新程度很低。


说到底还是套路重复,方法不及时迭代,这也是为什么现在纯生信想发高分越来越难,通常会被要求补实验才好发。


想要降低发文难度,必须升级方法和套路!


机器学习就是这样一个发高分利器。仅仅2021年一年,生信+机器学习的套路已经在10+SCI上发了近60篇文章!



所谓机器学习,是指利用算法来检测数据中的模式,而不需要明确的指示。一个学习系统可以利用训练数据集,学会找出输入信息(例如图片)的特征与输出信息(如标签)之间的关联。


机器学习在生信分析中的运用越来越常见,越来越重要。


比如在基因组数据方面,用深度学习检测突变逐渐成为主流方法。


比如群体基因组学领域的PRS,用于基于基因组数据预测生物性状,这就是个典型的机器学习预测问题。


比如非肿瘤研究中,可以用机器学习来评估我们诊断标志物的诊断效力。


临床预测模型、筛基因、二代测序、代谢通路、非编码RNA分析、蛋白质结构功能预测、疾病亚型分型、术后预测……机器学习在这些方面的运用已经越来越多见了。


所以啊,不要再观望了,速度学起来,才能先人一步发高分,而不是做被师弟师妹甩在身后的人(哭了)。




2

PRAT

资料册里有什么秘籍?


157页机器学习资料合集,从什么是机器学习,到超多实用算法详解,再到教你如何将机器学习与生信结合,手把手带领大家走上发生信高分的康庄大道。


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12篇7万+字教程文详解如何用机器学习发高分


在机器学习的帮助下,如何结合生存信息对基因表达情况进行变量的筛选与降维处理?非肿瘤研究中,如何用机器学习来评估诊断标志物的诊断效力?如何用机器学习改进临床预测模型……


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