Nature重磅综述||新冠当下!科研人员如何用更少的经费,发更高质量的文章
机器学习单细胞分析:细胞生物学的相关研究一直受限于数据的完整性和表型的完整性,对应激状态和稳态下的细胞区别观察不够充分。过去五年中,计算机视觉和语音识别领域通过对大量的无标签数据进行学习、建模,很好的解决了数据不足的问题。同样在最近的研究中,机器学习方法使用单细胞数据进行扰动建模也推动了细胞生物领域前进。对于生物学家来讲,无论研究基因、转录本、修饰、蛋白功能,都要频繁的进行人为干预,实现对感兴趣变量的正向或者反向改变,观察细胞表型的变化。整个过程需要对干预工具的构建、导入、实验观察,从而得出表型结论。扰动建模的目的就是想要通过数学模型的建立,通过对已有数据的分析、归纳和总结,对一个分子的功能在没有湿实验时做出预判,对于生物学家和药物研发者来讲,好的模型一定能够帮助加深对生物机制的理解,推动药物的研发进程
深度学习在基因组学应用:深度学习已经被广泛应用于基因组学研究中,利用已知的训练集对数据的类型和应答结果进行预测,深度学习,可以进行预测和降维分析。深度学习模型的能力更强且更灵活,在适当的训练数据下,深度学习可以在较少人工参与的情况下自动学习特征和规律。调控基因组学,变异检测,致病性评分成功应用。深度学习可以提高基因组数据的可解释性,并将基因组数据转化为可操作的临床信息。深度学习通过强大的深度神经网络模型从高维大数据中自动挖掘数据潜在特征得以实现,过去10年,深度学习在计算机视觉、语音识别、自然语言处理领域取得了巨大成功。基因组学大数据与疾病表型间的复杂关系难以解析,运用深度学习挖掘多组学数据探索复杂疾病致病机制及药物反应机制将会极大的提升精准医学和转化医学的进度。,近两年国内外顶尖课题组MIT、Harvard University、UPenn、清华大学、复旦大学等都在从事深度学习基因组学的研究,这一研究成果更是多次发表在Nature Reviews Genetics、Nature Methods、Science Advances、Cancer Cell、Nature Biotechnology等知名国际顶刊上,为我们发表顶刊鉴定了基础。
单细胞空间转录组应用:“单细胞多组学技术”和“空间转录组技术”先后在2019年和2020年被Nature Methods评为年度技术方法。时间和空间维度多维研究技术结合,将以全新研究思路出发,既能够获得单个细胞间异质性,又能获得细胞在组织空间上的结构位置信息,发现更多未知且精细化结果。总而言之,单细胞测序+空间转录组测序:优势互补,同时获得细胞类型群体,以及基因表达和细胞的空间位置信息。空间转录组能够定位和区分功能基因在特定组织区域内的活跃表达,为研究和诊断提供宝贵见解。10x Visium 的推出使空间转录组成为了新的研究热点,受到广大研究者的青睐,其不仅可以提供研究对象的转录组等数据信息,同时还能定位其在组织中的空间位置,这对于癌症发病机制、神经科学、发育生物学等众多领域的研究都有重要意义。
CADD计算机辅助药物设计:CADD(Computer Aided Drug Design):计算机辅助药物设计,依据生物化学、酶学、分子生物学以及遗传学等生命科学的研究成果,针对这些基础研究中所揭示的包括酶、受体、离子通道及核酸等潜在的药物设计靶点,并参考其它类源性配体或天然产物的化学结构特征,以计算机化学为基础,通过计算机的模拟、计算和预算药物与受体生物大分子之间的相互作用,考察药物与靶点的结构互补、性质互补等,设计出合理的药物分子。它是设计和优化先导化合物的方法,CADD的应用,包括基于结构的药物设计(SBDD)、基于配体的药物设计(LBDD)、高通量虚拟筛选(HTVS)等技术,突破了传统的先导物发现模式,极大地促进了先导化合物发现和优化。特别是在食品、生物、化学、医药、植物、疾病方面应用广泛!靶点的发现与确证是现代新药研发的第一步,也是新药创制过程中的瓶颈之一。CADD的应用可以加快靶点发现的速度,提高靶点发现的准确度,从而推进新药研发。
刘老师,生物信息学博士,有十余年的测序数据分析经验。研究领域涉及人工智能、自然语言处理、功能基因组学、转录组学、miRNA及靶基因网络分析,单细胞测序数据分析,基因调控网络时序分析,蛋白质互作网络分析,多组学联合分析等。主持省自然科学基金等项目4项,出版医学实用教材《Python医学实战分析》,发表SCI论文22篇,其中一作及并列一作9篇。
陈老师和张老师授课。在国内外学术刊物发表论文数篇,包括Nature Communication, Cell Regeneration等知名期刊,研究方向为生物信息学,发育生物学和遗传学等。利用多组学数据,通过深度学习算法进行数据分析和挖掘,包括ChIP-seq,ATAC-seq,RNA-seq,CNV等。
课程一:深度学习在基因组学应用专题线上培训班
课程二:机器学习单细胞分析应用专题线上培训班
课程三:单细胞空间转录组应用专题线上培训班
课程四:CADD计算机辅助药物设计线上培训班
2022.12.12-2022.12.15 晚上授课 (晚上 19.00-22.00)
2022.12.17-2022.12.18 全天授课(上午 9.00-11.30 下午 13.30-17.00)
2022.12.19-2022.12.22 晚上授课(晚上 19.00-22.00)
2022.12.10-2022.12.11 全天授课 (上午 09.00-11.30 下午 13.30-17.00)
2022.12.17-2022.12.18 全天授课 (上午 09.00-11.30 下午 13.30-17.00)
2022.12.24-2022.12.25 全天授课 (上午 09.00-11.30 下午 13.30-17.00)
2022.12.17-2022.12.18 全天授课(上午 9.00-11.30 下午 13.30-17.00)
2022.12.19-2022.12.22 晚上授课(晚上 19.00-22.00)
2022.12.10 -----2022.12.11 全天授课(上午09.00-11.30 下午13.30-17.00)
2022.12.13-----2022.12.16 晚上授课(晚上19.00-22.00)
2022.12.17-----2022.12.18全天授课(上午09.00-11.30 下午13.30-17.00)
2022.12.19 -----2022.12.20晚上授课 (晚上19.00-22.00)
(腾讯会议直播上课 线上实操,提供录像回放 录像永久观看)
报名费用可开具正规报销发票及提供相关缴费证明、邀请函
可提前开具报销发票、文件用于报销
深度学习基因组学 机器学习单细胞分析 计算机辅助药物设计
公费价:每人每班¥5880 元 (含报名费、培训费、资料费)
自费价:每人每班¥5480 元 (含报名费、培训费、资料费)
单细胞空间转录组:
公费价:每人每班¥5080 元 (含报名费、培训费、资料费)
自费价:每人每班¥4680 元 (含报名费、培训费、资料费)
优惠
优惠1:两班同报:9880元 三班同报:13880元 四班同报:17880元
优惠2:提前报名缴费学员+转发到朋友圈或者到学术交流群可享受每人400元优惠(仅限15名)
优惠3:同时报名两个班免费赠送一个学习名额(赠送班任选)
优惠4: 报名五个培训班以上,免费赠送三个培训名额(赠送班任选)
证书:参加培训并通过考试的学员,可以申请获得工业和信息化部工业文化发展中心颁发的“工业强国建设素质素养提升尚工行动”岗位能力适应评测证书。该证书可在中心官网查询,可作为能力评价,考核和任职的重要依据。评测证书查询网址:www.miit-icdc.org(自愿申请,须另行缴纳考试费500元/人)
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报名缴费成功赠送报名班型全套预习视频,课后学习完毕提供全程录像视频回放,针对与培训课程内容 进行长期答疑,微信解疑群永不解散,参加本次课程的学员可免费再参加一次本单位后期组织的相同的 专题培训班(任意一期都可以)
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通过腾讯会议线上直播,理论+实操的授课模式,老师手把手带着操作,从零基础开始讲解,800余页电子PPT和教程+预习视频开课前一周提前发送给学员,所有培训使用软件都会发送给学员,有什么疑问采取开麦共享屏幕和微信群解疑,学员和老师交流、学员与学员交流,培训完毕后老师长期解疑,培训群不解散,往期培训学员对于培训质量和授课方式一致评价极高
腾讯会议问题实时解答
(二)学员对培训非常认可,而且我们保证二次学习是免费的
往期参会单位
国外院系高校;有来自麻省理工大学、University of Bristol (布里斯托大学)、加州伯克利大学、Osaka University(大版大学)、乔治梅森大学、加州理工大学、曼彻斯特大学 、莱斯大学、波士顿大学、德州 农工大学、德雷克大学、美国联合大学、普林斯顿大学、斯坦福大学、Imperial College London、 KAUSTuniversity、理海大学、TheUniversityofQueensland、澳大利亚昆士兰大学、耶鲁大学、牛 津大学、剑桥大学、匹兹堡大学、悉尼大学、多伦多大学、西雅图华盛顿大学、伦敦大学、杜克大学、东 京大学、哥伦比亚大学、康奈尔大学、纽约大学、西北大学、布朗大学、华盛顿大学
国内院系高校;有来自中山大学肿瘤防治中心(中山大学附属肿瘤医院、中山大学肿瘤研究所)、中山大 学、北京大学第一医院、中国医学科学院北京协和医院、西北民族大学、西南大学、山东大学、加州伯克 利大学、启元实验室、中国人民解放军总医院第一医学中心、河南师范大学、南京工业大学、南方科技大 学、南京大学、中国医学科学院基础医学研究所、青海省农林科学院、天津中医药大学第一附属医院、山东大学、黑龙江八一农垦大学、南昌大学第二附属医院、台州市中心医院(台州学院附属医院)、宁波大 学附属人民医院、新疆农业大学、北京林业大学、广西医科大学、湖南文理学院、滨州医学院、滨州医学 院烟台附属医院、华南师范大学、中国环境科学研究院、云南师范大学、昆明理工大学、湖北医药学院、 苏州大学、福州大学、南方医院、南昌大学第二附属医院、深圳市中医院、湖南文理学院、河南科技学 院、福建省立医院、中南大学湘雅医院、深圳市中医院、省立同德医院、内蒙古科技大学包头师范学院、 乌鲁木齐市疾病预防控制中心、中国林业科学研究院林业研究所、中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究 所、鲁东大学、河北工程大学、南方医科大学珠江医院、首都医科大学附属北京妇产医院、重庆医科大学 附属第二医院、北京普利智诚生物技术有限公司、复旦大学上海医学院、陕西中医药大学附属医院、中国 医学科学院血液病医院(中国医学科学院血液学研究所)、滨州康达欣医疗器械有限公司、深圳北京大学 香港科技大学医学中心、天津市肿瘤医院、陆军特色医学中心、空军军医大学第一附属医院、江南大学、 中国科学院深圳先进技术研究院、中国科学院上海营养与健康研究所、北京阅众时刻文化传媒有限公司、 北京慧康健怡医疗器械有限公司、杭州奥明基因科技有限公司、亦欣生物科技无锡有限公司、广州市肖悦 生物科技有限公司、张家口泽涵生物科技有限公司、平安科技。感谢对我们培训的认可!还有许多因为时 间冲突无法参加。这次我们诚挚邀请您来参加!
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电子邮箱:
报名电话:15238680799
引用往期参会学员的一句话:
Hanson声明:本培训由第三方提供
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