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走进美国人文系列(十八)美国如何准确判断和预测疫情的

走进美国人文系列(十八)美国如何准确判断和预测疫情的

科学

走进美国人文系列(十八)

美国如何准确判断和预测疫情的

01/10/2023


动力大固然好,没刹车会要命(63语录)


最近国内放开管控,导致新冠疫情呼啸而来,WHO一直敦促中国发布新冠感染有关现状,但作为曾经在国内疾病预防领域工作过的自己知道:难度不小!


即使美国,流行高峰期的感染数据,也是很不准确的。很多在家诊断或者根本没有诊断的感染阳性病例、隐性感染病例、遗漏未报的病例等等,都不计其数,美国CDC公布的数据,也只是获得检测资格的机构上报的数据。


不过,美国这个老牌资本主义国家,还真有一套纠偏机制,对这种不准确的数据,完全能做到“心中有数”


一直不了解美国这个“无政府主义”国家的运行机制,总觉得,这种“大社会、小政府”的管理模式,为社么不会“乱象丛生”,这其中,肯定有什么纠错机制,让这个在道路上行驶了200多年的“巨型破卡车”不至于陷入泥潭,或者是掉入悬崖。


等在美生活时间长了,发现美国这个“破卡车”虽然油门动力不大,但它有一个最好的操作系统,这就是:刹车系统!出现问题了,能及时刹车。


动力大固然好,没刹车会要命。


这次新冠疫情的爆发,又一次让咱看到了这样“系统”的一个侧面。


上个世纪40年代,美国就建立了“国家废水监测中心”(National Wastewater Surveillance System Center),该机构隶属于CDC,中心通过对城市产生的废水检验,来监测该城市传染病流行和某些药物使用等情况。这次新冠大流行,该系统较好地完成了从病毒流行株、流行范围到流行趋势、时间节点等多方面的监控和准确的预测,比临床医务工作者上报的资料更为科学。(根据个人经验,人为上报系统错报、漏报、不报等现象非常常见)


就拿咱生活的城市休斯顿举例吧,看看这套系统是如何操作的。


休斯顿承担对污水样品“新冠病毒核苷酸”检测的有两家实验室,一个是休斯顿卫生局下属的实验室,一个是莱斯大学(Rice University)的实验室,莱斯大学还有一个团队,负责资料分析。


20205月,对新冠病毒疫情的监测被纳入这两家实验室常规的检测。


休斯顿有39个污水处理厂,涵盖200多万人口的污水处理。根据公开资料显示,污水里对新冠病毒检测过程包括:样品浓缩、核苷酸提取和纯化,定量等等。(网络上有方法学的详细介绍)


这是休斯顿一家污水处理厂,动力系统看上去是太阳能的,旁边的小河是休斯顿排污河,被处理好的污水,就直接排放到这个小河里,小河穿城而过,长达数十公里,也是休斯顿排洪的主要河流。

左上角隐约有几座高楼,那是市中心。整个休斯顿看上去就是一个大农村


休斯顿电视台也对结果进行跟踪报道,在固定时段,几乎都有主持人通报污水监测疫情结果,这不,最近疫情有抬头趋势,各个单位又开始了新一轮“严重警告”!但根据咱的观察,老美似乎对疫情“见怪不怪”了,周末商场里都是不戴口罩的人挤人。


监测结果每周公布,普通民众可以在网络上查阅。


该资料所有数据,都是以202076日做参比(设定该数据为100),估计这是方法学建立后,第一次检测得到的数据,因为没有绝对值,后面的数据,就只有参照这个“本底数据”了。


这个项目还有一个值得关注点,就是对全休斯顿学校疫情的监测。项目负责人从一开始,就把学校污水监测纳入了常规,让管理者能够很准确地判断每个学校的流行现状,从而帮助政策制定。(难怪很多学校经常通知在家上网课呢)


下面,咱截取部分结果图,和读者分享一下。


这是休斯顿2023年元月2日监测结果,数据反映,和2020年7月6日比较,增加到999%,也就是说,近期废水中新冠病毒核苷酸量,是那个时候的10倍了,难怪咱们医院院长发来了通知,要大家注意防护,在医院期间,最好戴口罩(不是必须戴口罩,非强制性的


院长给每个员工发的邮件,提醒大家注意自己保护


咱们看看医学中心废水中病毒核酸载量多少?医学中心邮编是77030,载量也是10倍左右(985%),资料里还有疫苗覆盖率。医学中心居民素质偏高,疫苗覆盖率100%,咱查阅资料发现,休斯顿有很多地区,有30%以上的人口,没有打过疫苗


谷歌一下休斯顿疫情曲线图,2022年一月份是高峰,但由于下半年美国CDC不要求各检测机构上报感染人数,后面疫情数据则完全不准确了,加上美国政府把新冠自测检测盒寄到民众家里,大部分民众即使测出阳性,也没有上报CDC,也就是说,目前美国统计的感染人数,远远少于实际感染数

没有人工上报并不妨碍CDC对疫情的掌握,请看下面这张图,这是休斯顿废水里新冠病毒核苷酸检测趋势图,从2020年7月6日第一次结果开始(第一次结果为基数100)。图中红框最高值,就是2022年1月检测数据,和人工报告的上图数据吻合,但后续几波疫情,上图谷歌出来的人工报告没有反映真实数据,而下图这个废水检测报告,则较好地反映了疫情情况。

从这个图可以看出,目前疫情又在爬高,这是为什么,院长提醒大家注意的原因,原来是数据说话


这个图老百姓看上去更直接,颜色越红,说明载量越高,而竖坐标是休斯顿各个地区,横坐标是时间轴,从图像可以看出,从2020年7月6日开始,休斯顿已经有了5波疫情,目前处于第5波


这里还有休斯顿各个学校检测结果,其中,图片中心的数据,不仅仅包含新冠病毒,还有流感病毒检测数据


这是流感监测结果,红色为高载量地区,从图上可以看出,目前休斯顿属于流感流行高峰期


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