Redian新闻
>
全基因组遗传筛选揭示了人类色素沉着的决定因素

全基因组遗传筛选揭示了人类色素沉着的决定因素

公众号新闻

点击上方蓝字关注“尹哥聊基因”

最近微信改版,容易找不到尹哥的文章,大家记得把尹哥设为星标⭐️ 哦~

肤色是人类最多样化的特征之一,它是由黑色素的数量、类型和分布决定的。

2023年8月11日,斯坦福大学Joanna Wysocka团队在Science 在线发表题为 A genome-wide genetic screen uncovers determinants of human pigmentation 的研究论文,该研究利用黑色素的光散射特性对黑色素形成的调节因子进行了全基因组筛选,确定了169个功能多样的基因。这些基因聚集在黑色素小体的生物发生、内体运输和基因调控上,其中135个与色素沉着有关,这是以前未知的。

该研究进一步揭示了KLF6作为体内调节黑色素小体成熟和色素沉着的转录因子的功能,以及内体运输蛋白COMMD3在调节黑色素小体pH中的功能。该研究揭示了大量的黑色素促进基因,对人类变异、细胞生物学和医学具有广泛的意义。

皮肤和头发颜色是遗传衍生的特征,在人群之间和人群内部高度可变,并由黑色素的数量、类型和分布决定。黑素细胞发育起源于胚胎神经嵴细胞,位于表皮,并在称为黑色素小体的亚细胞溶酶体相关细胞器中合成黑色素。在黑色素合成过程中,黑色素小体经历了典型的成熟阶段,其中I期黑色素小体含有腔内小泡,II期黑色素小体沉积PMEL原纤维,在其上发生黑色素生成,III期和IV期黑色素小体分别代表部分和完全黑色素化的黑色素小体。成熟的黑色素小体被细胞外运输到周围的表皮角质形成细胞,导致皮肤和头发色素沉着。

人类色素沉着的关键见解来自与色素沉着不足和色素沉着过多疾病相关的基因定位,以及人类正常范围皮肤和头发颜色变异的候选基因和全基因组关联研究(GWASs)。

此外,对模式生物的研究,特别是对小鼠皮毛颜色的研究,已经揭示了与色素沉着有关的基因和途径,其中许多都集中在黑色素合成途径上。尽管如此,GWASs估计了在特定人群中发现的主要肤色遗传变异的累积贡献,只能解释所分析人群中相对较小的一部分肤色变异(23%~35%)。

同样,使用基于GWAS汇总统计的方法,作者估计来自UK Biobank(UKBB)的英国白人个体中,只有15.2%的肤色变异可以用与该人群的全基因组显著肤色GWAS匹配的基因组区域集来解释。

综上所述,这些观察结果表明,尽管人们已经发现了控制人类色素沉着的关键基因座,但其他有贡献的基因座仍有待发现。

△ 基因筛选发现了以前未确定的人类黑色素形成的位点(来源:Science )

黑色素是一种异质且结构不明确的生物聚合物,包括两种形式,即黑色或棕色的真黑色素和红色或黄色的现象黑色素。产生的黑色素的数量和类型决定了其物理化学性质,如高折射率,这构成了黑色素特有的吸光和散射特性的基础。这些被认为是保护皮肤免受阳光照射相关损伤的关键。

该研究证明了细胞黑色素浓度确实决定了色素细胞的光散射特性。利用这一特征,并使用SSC作为黑色素水平的代表,进行了基于CRISPR-Cas9的遗传筛选,以鉴定人类色素沉着的调节因子,从而发现了169个具有黑色素生成前功能的候选基因。该研究验证了筛选命中的一个子集,证实了它们在来自深色皮肤个体的原代黑素细胞中的转录上调,以及它们参与黑色素小体生物发生的不同阶段。此外,通过后续的功能研究,该研究发现转录因子KLF6在体内黑色素小体成熟和色素沉着中的作用,以及内体运输蛋白COMMD3在调节黑色素小体pH中的作用。因此,该研究将为进一步研究人类肤色多样性的遗传结构提供丰富的资源。

文章来源“iNature”

责编 | 文竞择  校对 | 文竞择


— END —


微信扫码关注该文公众号作者

戳这里提交新闻线索和高质量文章给我们。
相关阅读
芝加哥大学贺教授 :基于全基因组关联(GWAS)数据的基因突变问题研究|收获一作论文与导师推荐信!明天这件大事,决定不了人类的命运合成生命的里程碑!科学家首次改造了真核生物超过50%的基因组;数学家发现提高体外受精成功率的方法 | 环球科学要闻“吃苦教育”到底有没有用?一条热搜揭示了一个残酷的真相……服务超5000名用户、检测2万多人基因组序列,这家企业通过基因组测序对抗衰老 【衰老标志物检测】"全球最丑草坪"竞选揭晓:获胜者是这位澳大利亚人!评比引领节水新潮流喝酒脸红是怎么一回事?死里逃生,大病初愈三个历史细节揭示了巴以冲突的真相正视不平等的遗传因素Nature子刊 | 清华大学孙前文实验室揭示DNA引物酶促进转录复制间的竞争并影响基因组稳定性的新机制Science | 你为什么长那么白的原因被揭示:全基因组遗传筛选揭示了人类色素沉着的决定因素男女收入差距为何始终存在?诺贝尔经济学奖得主克劳迪娅·戈尔丁揭示了答案创建茶学国家重点实验室!安徽农大宛晓春教授:45年坚守茶学研究,取得率先绘制中国种茶树的基因组图谱等重大成果异军突起的视频AI,揭示了什么?女教师被家长举报数十次冲上热搜:跪着的老师,教不出站着的学生博后招募 | 香港中文大学计算基因组宋永健老师招聘生物信息学研究员/博士后新增到50万个体的完整基因组,全球最大的人类基因组数据库开放获取!【12月7日】始终走在基因组技术前端-Oxford Nanopore核心实验室线上研讨会PNAS| 耶鲁大学张行健等人发现癌细胞在受到外力作用时表现出的进化特征并揭示了一种新的癌细胞抗药机制Cell Research | 清华大学颉伟组揭示哺乳动物基因组激活到第一次细胞命运决定转换的分子机制成功获取!6000年前古人类基因组数据旅美散记(14):骑士威克走進咖啡屋微软“薪资泄露”揭示了科技公司高层员工的薪资...奖金金额令人瞠目结舌晚讯 |HIV首个长效注射治疗方案在中国获批、美国FDA将评估基因组编辑疗法的安全性两篇Cell+5篇Cell子刊首次成功在实验室中制造出合成基因组超过50%的酵母菌株第七章第二节 哥白尼的日心说晚讯 |英国生物银行发布50万人完整基因组序列、科济药业回应FDA调查CAR-T细胞疗法Genome Research | 姜雨教授团队揭示了中国南方黄牛竟然是来自五种以上不同野牛的杂交后代携5000万美元正式亮相,FP孵化的初创基于「体细胞基因组学」开发新疗法Nature:超越ChatGPT,思维更像人类的人工智能诞生,具备了人类举一反三的能力Autophagy | 扬州大学刘珏等团队合作揭示了病毒使用多样策略以逃避宿主自噬机制和类型I IFN应答以求生存的新模式Nature |利用6156个人类基因组序列成功构建出人类基因组约束图谱揭秘囊性纤维化的遗传密码,直接促使人类基因组计划;离诺奖最近的华裔科学家之一:徐立之博士
logo
联系我们隐私协议©2024 redian.news
Redian新闻
Redian.news刊载任何文章,不代表同意其说法或描述,仅为提供更多信息,也不构成任何建议。文章信息的合法性及真实性由其作者负责,与Redian.news及其运营公司无关。欢迎投稿,如发现稿件侵权,或作者不愿在本网发表文章,请版权拥有者通知本网处理。