Redian新闻
>
基于RNA测序分析中国人群MET 14号外显子跳跃突变的发生率及其与PD-L1表达相关性

基于RNA测序分析中国人群MET 14号外显子跳跃突变的发生率及其与PD-L1表达相关性

公众号新闻

  *仅供医学专业人士阅读参考


间充质-上皮转化(MET)14号外显子跳跃突变(MET 14跳突)是一种独特的非小细胞肺癌(NSCLC)驱动基因变异。临床上,MET 14号外显子跳跃突变最常见的检测方法是DNA测序。然而,由于一些不包含MET 14号外显子剪接点的体细胞变异也可能导致MET 14跳突。因此,RNA测序才是检测MET 14跳突最准确的方法。有研究者基于RNA测序分析了中国人群MET 14跳突的发生率及其PD-L1表达情况的相关性,本文对此进行解读和分享。

背景


NSCLC约占所有肺癌的85%,其中腺癌(ADC)和鳞状细胞癌(SCC)是NSCLC最常见的组织亚型,分别占50%和30%[1]。近期,MET基因的激活突变逐渐被公认为NSCLC的潜在治疗靶点。MET是一种受体酪氨酸激酶,当与肝细胞生长因子(HGF)配体结合时被激活,形成同源二聚体,随后激活激酶结构域。这个过程可触发下游信号通路级联反应,促进肿瘤细胞增殖、细胞周期进展、迁移和侵袭。MET的异常激活还可触发下游PI3K/AKT/mTOR和RAS/ERK/MAPK通路的结构性激活,参与肿瘤的发生和发展[2]

MET 14跳突已被证实是NSCLC治疗靶点,在TCGA数据库肺ADC中发生率为4.3%[3]。MET 14跳突可导致E3泛素蛋白连接酶(CBL)有效结合所必需的膜旁区域缺失,导致MET的稳定性和致癌潜力增加,并增加了对MET酪氨酸激酶抑制剂(TKI)的敏感性[4]。MET 14跳突在台湾NSCLC患者发生率约为4.0%,香港为2.6%,中国大陆为0.9%,韩国为2.13%,美国为2.1%-3%[4-6]。MET 14跳突发生率的差异可能与检测方法学、标本来源和种族差异有关。在本研究中,研究者使用基于靶向RNA的下一代测序(NGS)检测了951例中国NSCLC患者MET 14号外显子的变异情况。此外,在这些患者中,NSCLC其他主要驱动基因突变和PD-L1表达情况也被一并分析。

研究结果


本研究共纳入951例NSCLC患者,其临床特征总结如表1所示。入组患者的中位年龄为63岁,男性占55.3%(526/951)。吸烟史方面,51.1%(454/888)的患者从不吸烟,48.9%(434/888)曾经吸烟(63例资料缺失)。组织学亚型主要为ADC(81.2%,772/951)和SCC(15.9%,151/951)。其他组织学亚型包括腺鳞癌(ASC,1.2%,11/951)、大细胞癌(LCC,0.7%,7/951)、肉瘤样癌(SC,0.4%,4/951)和粘液表皮样癌(MEC,0.1%,1/951)。可获取病理分期信息的608例患者中,I期占17.3%(105/608),II期占4.4%(27/608),III期占16.4%(100/608),IV期占61.9%(376/608)。

表1. 入组患者的基线特征

检测到16例MET 14跳突,占NSCLC患者总数的1.7%(16/951)(图1A)。其中ADC 14例(87.5%),ASC 1例(6.3%),SC 1例(6.3%)。本研究未在SCC或其他组织学类型检测发现MET 14跳突。ADC和非鳞NSCLC的发生率分别为1.8%(14/772)和2.0%(16/800)。在本研究中,肿瘤标本是通过三种不同的方法获得的:手术切除、经皮肺活检(PTNB)和经支气管镜肺活检(TBLB)。NSCLC手术切除标本中MET 14跳突的检出率为2.3%(8/344),在ADC中为2.0%(6/307)(图1A)。951例NSCLC患者驱动基因突变情况如图1所示:EGFR突变444例(46.7%),KRAS突变99例(10.4%),ALK重排52例(5.5%),ERBB2突变31例(3.3%),BRAF突变18例(1.9%),ROS1重排13例(1.4%),ERBB4突变12例(1.3%),RET重排10例(1.1%)。也在ADC人群中评估了基因改变的比例(图1,左图)。与总体NSCLC患者相比,ADC中EGFR突变和ALK重排的比例略高。

图1. NSCLC(A)和肺腺癌(B)中不同来源标本驱动基因检出情况


表1展示了16例携带MET 14跳突的患者临床病理特征。除1例患者(59岁)外,其余均>60岁。MET 14跳突NSCLC患者与其他驱动基因突变NSCLC患者的中位年龄有显著差异,如ALK(66 vs 54,P=0.001)和ROS1(66 vs 59,P=0.010;图2A),表明MET 14跳突患者比其他驱动基因突变患者年龄更大。此外,MET 14跳突和野生型患者中,性别和从不吸烟的比例没有显著差异。未发现MET 14跳突与肿瘤原发灶位置和分期之间存在显著的关联(图2B和C)。

图2. MET 14跳突患者的临床特点。(A)具有不同驱动基因突变的患者中位年龄。(B) MET 14跳突和野生型群体的性别比例。(C) MET 14跳突和野生型群体的吸烟史比较。(D)PD-L1在MET 14跳突、MET 14野生型、EGFR突变和EGFR野生型群体中的表达状况。


共有364例患者进行了c-MET免疫组化(IHC)检测并归入c-MET队列。根据染色强度(阴性、弱、中、强)和肿瘤细胞的阳性率,c-MET队列中的患者被分为4个亚组:3+(n=49,13.5%)、2+(n=160,44.0%)、1+(n=122,33.5%)和0(n=33,9.0%)。c-MET队列有MET 14跳突患者7例,3例(42.9%)评分为3+,3例(42.9%)评分为2+,1例(14.2%)评分为1+。MET 14跳突、MET 14野生型患者中分别有85.7%(6/7)和56.9%(203/357)的NSCLC患者出现MET过表达,卡方检验显示两组间无显著差异(P=0.253)。

当有足够的组织标本时,研究者使用IHC评估PD-L1的表达状态。采用肿瘤比例评分(TPS)评价PD-L1蛋白的表达情况。在401例接受PD-L1表达检测的患者中,PD-L1阴性(1%<TPS)196例(48.9%),低表达(1%≤TPS≤49%)132例(32.9%),高表达(TPS≥50%)73例(18.2%)(表1)。本队列中有13例携带MET 14跳突的患者,其中PD-L1高表达9例(69.2%),PD-L1低表达或阴性4例(30.8%)(表1)。MET 14跳突和MET 14野生型患者PD-L1表达状态差异有统计学意义,携带MET 14跳突的NSCLC患者PD-L1倾向于高表达(69.2% vs 17.3%,P<0.01)。相反,与EGFR野生型患者相比,EGFR突变患者PD-L1高表达的比例显著更低(9.3%比26.9%,P<0.01;图2D)。

基于DNA和RNA的NGS被用于识别肺癌相关基因改变,包括融合、截断、框内突变和错义突变。在16例MET 14跳突患者中,1例EGFR外显子19缺失,突变丰度低(EGFR c.2240_2257 del,1.41%)。其他常见致癌驱动基因如KRAS、ALK、ROS1、RET等均未发现与MET 14跳突相关的突变。在EGFR/KRAS/ALK/ROS1/RET野生型NSCLC患者中,MET 14跳突检出率为4.7%(16/340)。作为一种主要的抑癌基因,TP53共突变在驱动基因突变阳性人群中广泛存在。在本研究中,48%(444/935)的NSCLC患者检测到TP53突变,其中46.2%(205/444)携带EGFR突变,49.5%(49/99)携带KRAS突变,21.2%(11/52)携带ALK重排,38.5%(5/13)携带ROS1重排,20%(2/10) 携带RET重排。在MET 14跳突和野生型患者中,TP53共突变的比例分别为37.5%(6/16)和47.5%(444/935),两组间差异无统计学意义。

结论


根据基于RNA的NGS评估结果,东亚人群肺ADC MET 14跳突的发生率与西方人群相近。MET 14跳突NSCLC患者年龄大于其他驱动基因突变患者,如EGFR、ALK和ROS1。此外,PD-L1倾向于在MET 14跳突NSCLC患者中高表达。


本文主要参考

[1]Xu Z, Li H, Dong Y, et al. Incidence and PD-L1 Expression of MET 14 Skipping in Chinese Population: A Non-Selective NSCLC Cohort Study Using RNA-Based Sequencing. Onco Targets Ther. 2020;13:6245-6253. Published 2020 Jun 30. doi:10.2147/OTT.S241231。

其他参考文献
[1]Hirsch FR, Scagliotti GV, Mulshine JL, et al. Lung cancer: current therapies and new targeted treatments. Lancet (London, England). 2017;389(10066):299-311.
[2]Sadiq AA, Salgia R. MET as a possible target for non-small-cell lung cancer. Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology. 2013;31(8):1089-1096.
[3]Comprehensive molecular profiling of lung adenocarcinoma. Nature. 2014;511(7511):543-550.
[4]Frampton GM, Ali SM, Rosenzweig M, et al. Activation of MET via diverse exon 14 splicing alterations occurs in multiple tumor types and confers clinical sensitivity to MET inhibitors. Cancer discovery. 2015;5(8):850-859.
[5]Awad MM, Oxnard GR, Jackman DM, et al. MET Exon 14 Mutations in Non-Small-Cell Lung Cancer Are Associated With Advanced Age and Stage-Dependent MET Genomic Amplification and c-Met Overexpression. Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology. 2016;34(7):721-730.
[6]Schrock AB, Frampton GM, Suh J, et al. Characterization of 298 Patients with Lung Cancer Harboring MET Exon 14 Skipping Alterations. Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer. 2016;11(9):1493-1502.

受众声明:本材料由阿斯利康提供,仅供医疗卫生专业人士参考。
审批编号:CN-124368   过期日期 2024-11-14


*“医学界”力求所发表内容专业、可靠,但不对内容的准确性做出承诺;请相关各方在采用或以此作为决策依据时另行核查。


微信扫码关注该文公众号作者

戳这里提交新闻线索和高质量文章给我们。
相关阅读
[旅游] 人生就是一场体验,到达相同的终点,体验不同的旅程——可可托海滑雪游记席琳·迪翁最新纪录片制作完成,记录其与罕见病抗争过程​聚焦肺癌罕见靶点检测相关分析,着力优化临床检出率及检测手段|2023 ESMO2023 WCLC | BRAF基因突变在欧洲人群的发生情况【模板】潜在危险因素(血压)与临床症状(AD认知能力下降)的相关性研究;通过“横纵向”两层分析,发在领域内顶刊巴以无解的仇恨是人类文明的悲哀带你分析中国叙事中的人物原型PD-1/PD-L1研究2023:抑制剂已经造就药王;激动剂开始突破,机会就在这里!从两个最宏观的角度分析中国股市的估值和走向最航运 | 详细深入分析中国外贸9月进出口数据!租房住的人,老得更快:研究发现租房人群的衰老速度大于买房住人群(以及失业人群业界分析中山二院事件:须警惕一些“科研”实验室的风险单次准确率超97%!普译生物发布中通量纳米孔基因测序仪,实现高精准长读长测序巴以冲突分析中,为什么这么多人会犯错?最航运 | 详细深入分析中国外贸10月进出口数据以及行业动态!Moderna最新论文:用mRNA表达IgA单抗,被动防御病菌感染先声再明自研PD-L1/IL-15双抗获批新IND无注意力大模型Eagle7B:基于RWKV,推理成本降低10-100 倍PD-1/PD-L1研究投稿,这些期刊审稿最快!(SCI选刊2023)南开&山大&北理工团队开发trRosettaRNA:利用Transformer网络自动预测RNA 3D结构Ai Pin被曝宣传片两处事实错误;微软Copilot已与PDF集成;中科大利用AI合成催化剂丨AIGC大事日报患自闭症华男法拉盛散步突然晕倒失联!护士助其与家人团聚Spleen, 脾, 脾气AHA 2023|PROMINENT试验:Pemafibrate可降低下肢缺血性溃疡和坏疽的发生率生信工具大幅提高外显子移动元件插入的检出率;罕见病研究将出现再一轮突破瑞士自由行(二)微软Copilot已与PDF集成;Ai Pin被曝宣传片两处事实错误丨AIGC日报不作古体已有时日,得宣兄报近况,感而命笔并得三题,寄呈以慰远念(七律)Nature子刊|复旦大学郁金泰/程炜/董强/冯建峰:首次揭示下丘脑结构的遗传基础及其与神经精神疾病的关系重温经典 | 芒格论基本的、普世的智慧,及其与投资管理和商业的关系WebSocket是什么以及其与HTTP的区别销售额超辉瑞一倍,在美获2/3市场份额,GSK基于RSV疫苗表现上调全年营收预期时隔14年,Meta重回中国?腾讯或成Meta VR中国区独家代理招募宫颈癌患者@中山大学附属肿瘤医院及全国73家参研医院 I 全球首款申报上市的PD-1/CTLA-4靶向组合抗体QL1706哈马斯突袭以色列犯下反人类罪
logo
联系我们隐私协议©2024 redian.news
Redian新闻
Redian.news刊载任何文章,不代表同意其说法或描述,仅为提供更多信息,也不构成任何建议。文章信息的合法性及真实性由其作者负责,与Redian.news及其运营公司无关。欢迎投稿,如发现稿件侵权,或作者不愿在本网发表文章,请版权拥有者通知本网处理。