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新冠周报丨这个秋冬季,新冠病毒进化趋势

新冠周报丨这个秋冬季,新冠病毒进化趋势

科学
用数据,来辨清事实。


关键词:COVID-19;Omicron;进化

如前,本次周报我们

1)先回顾过去1周的新冠领域重要研究;

2)复习目前全球疫情;

3)最后部分,和各位朋友谈一下”今年秋冬季,新冠病毒的进化趋势“



A,过去1周新冠疫情的
重要进展

简单总结过去1周的最新研究进展,主要是:
1,新冠病毒不断进化,但是“趋同进化”趋势越来越明显。
2,目前的疫苗对于预防新冠病毒重症/病死,仍有很好的有效性。
3,面对Omicron,抗病毒药物Paxlovid的有效性再次得到验证。

Science will win(科学必胜)



B,全球新冠疫情:
未能继续改善

最近两周全球单日新增病例较前增高1%,全球平均每天新增45万病例。
每天病死人数较前降低6%,为1,443人
全球COVID-19病死率较疫情前两年已经大幅降低

(COVID-19新增病例数变化。图源:纽约时报疫情跟踪器)

从2022年开始,COVID-19病例病死率(CFR)大幅降低,一直在0.5%以下。目前是0.31%。
病死率与我们个人的新冠预后直接相关,提示着一个人感染新冠后死亡的概率。

(COVID-19病例病死率的变化。图源:数据世界)


从最近1周新增病例绝对数看,德国单日确诊病例最多,其次是法国、美国、意大利和日本
(10月8日,从新增病例绝对数看,德国单日确诊病例最多。图源:数据世界)

美国疫情:
进入到8月份,美国的总病例数持续降低
最近两周美国单日新增病例数降低26%,但每天仍有4万人感染;住院人数降低11%最近2周美国每日COVID-19病死人数较前降低11%,为380人/天。

(美国新增COVID-19和病死人数均有降低。图源:纽约时报疫情跟踪器)

但美国完成新冠疫苗基本接种的比例仍然非常低,只有68%,不仅远低于日本、韩国等东亚国家,也低于英国、德国等西欧国家。
所幸的是,美国老年人还比较理智。美国65岁及以上老年人的新冠疫苗基本接种率已经超过93%,加强接种比例超过66%


C,今年秋冬季,
新冠病毒的进化趋势


(2022年10月8日美国更新的新冠病毒检出分布)


从美国疾控中心(CDC)最新公布的新冠病毒检出分布可以看到,虽然具有R346突变的BA.4.6和BF.7逐渐增长,但增长速度很慢,取代BA.5的速度也十分缓慢

今年4月的预测现在正在被验证。
1,Omicron突变株已经接近SARS-CoV-2进化的一种极限形式
2,也许今后的病毒流行趋势就是Omicron+这种新亚型。
3,2022年以后每次对于毒株、亚型和疫情高峰时间的预测都很精确,这源于分子流行病学在疫情中的不断完善。

Bedford更新新冠病毒分子流行病学分析;关乎疫情走向,这三个突变株最为重要。。。


这可能是因为R346突变在BA.5的基础上并没有增加更多的中和抗体逃逸,因此BA.5既往感染对BA.4.6和BF.7依然具有较好保护力。
所以我今年四月预测的也许今后的病毒流行趋势就是Omicron+L452R/Q这种新亚型(BA.5),这个预测是现在真实在发生的;更为重要的是,我当时说,BA.5可能已经是SARS-CoV-2单碱基突变的一种极限形式。

COVID-19让分子流行病学、病毒分子遗传学和血清学空前发展,现在根据病毒氨基酸突变判断其潜在的流行趋势可以做到非常准确。

新冠病毒的趋同进化的大趋势,使得人类对于今年冬天的疫情有一个大概的预估:


1,今年秋冬季仍会有新的疫情波动,与BA.5类似。

实际上,欧洲已经又开始了新的一波。

Nature解说:这个冬季会有新冠浪潮吗?多严重?


2,新冠感染的病死率已经很低。
新冠疫苗接种+早期抗病毒治疗,使得新冠感染的病死率已经很低,全球范围内的病死率为0.3%;这还是在很多人家庭检测出阳性、如果症状不重根本不会上报的背景下,实际的病死率会更低。


3,新冠感染的死亡率仍然不能忽视。
疫苗接种和抗病毒药物能够降低感染后病死率,但是由于新冠病毒的传染性极强、尤其加上了免疫逃逸使得疫苗接种者也会感染及传播病毒,所以在一个放开的社区中,人们几乎都可能接触到新冠病毒。
极高的感染率,就导致了整个国家/社区新冠病毒感染的死亡率仍会很高,这在未曾发生过大规模Omicron疫情的地区尤为突出;中国香港特区就是典型的例子。

在这种情况下,除了个人即使完成加强接种、及时就诊之外,公共卫生管理亦尤为重要,戴好口罩、减少聚集、做好流调等措施效果更明显。


资料来源:
【1】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions

最后,

祝朋友们:
一切顺顺利利、全家平平安安!


本期编辑Henry,微信号healsan。
Hanson临床科研团队,由6位在美国的医生及医学科学家组成;目前在美国主要从事新药研发和临床科研。
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