发文章太卷,学习太难,幸亏我找到了大神帮忙
01
初识解螺旋
我和解螺旋的渊源始于2018年,其实真的是很早了吧,但是那时候解螺旋的训练营不是很多,也不是很关注解螺旋,后面到了2020年后,我对解螺旋的关注就越来越多,酸菜老师的三十六策我才慢慢领悟了他的精髓所在,也就是这时候,我也慢慢开始接触挑圈联靠这个公众号。
我和雪球老师一样,是基础科研出身的,但是随着最近几年科研越来越卷,不得不掌握各种其他技能,生信就是个突破口。因为我是先接触解螺旋的,所以对于文献总体把握还是能够理解的,这对于生信入门是个不错的开端,至少我明白每一步我做的意义是什么,挑指的是表达差异,圈指的是聚类分析,联指的是交互网络,靠指的是临床意义。
02
大量输入学习资源
最初我是跟着解螺旋的生信体系课学习的,先学了生信全书上半部分,入了门,掌握了一些生信可视化网站的预测检索以及一站式出图的办法;
然后学习了全代码篇,也就慢慢接触了R语言,虽然大师兄开发了仙桃学术这个宝藏网站,只靠点点点就能做出发表级的图,但是我觉得R语言在自己还有时间的时候还是该好好学习的。
随着这两年跟着挑圈联靠公众号的学习,加上雪球老师每年都会开直播课,还有各种训练营,包括今年很多的成长营,比如GEO、TCGA、R语言从入门到精通和单细胞转录组测序等,甚至需要我每天学习5-6h的讲习营,真是干货满满。
有些时候不一定能学懂,但是我觉得解螺旋这个地方,只要你想学,就能学会,每个训练营会重复开很多次,还有助教答疑,有时候感觉学不会都对不起那些输出干货的老师。
然后学习过程中我也使用了各个助教和老师推荐的工具,比如Everything,Snipaste,Typora等,给我的生信学习之路直接按上加速键。我觉得一个人爱学习,还要善于学习,善于借助各种资源学习。
03
踏实进阶
虽然当时刚开始接触生信的时候,听信了生信培训班的宣传,以为两三天就能掌握自己所需的生信技能,后面发现生信学习是需要学习周期的,最好踏踏实实地去学习。我也明白了生信是一门综合性的学科,分析代码的背后是生物学背景知识、测序原理、统计知识、算法原理和计算机语言,这些知识和技能的掌握不可能一蹴而就。
自己在学习R语言的时候,也需要边运行看结果边学,而不是直接拿着别人给的代码一股脑运行;
自己动手试一下其实就知道这个代码可以干什么,遇到报错了,看看错误是什么,我会先理解下,然后改一下代码,大部分都能解决;
实在解决不了的我会问下会员助理,会员助理老师会很贴心的给我转发到一些生信大神那里帮我解决问题~
最后我觉得生信学习一个完整的科研过程应该包括以下几个部分:
1、首先有一个idea,他可能来源于文章,课题组,老师,同学,生活等;
2、然后去查找文献,就是把之前想到的ideas变成一组关键词,然后去搜索下载相应文献;
3、再根据自己的想法对文献进行筛选,留下自己认为可以复刻还原的文献,以及喜欢但是目前条件达不到的文献,并顺便留意下哪些期刊会成为自己的潜在目标;
4、确定实验设计:
在仔细阅读很多篇文献方法和结果图后,会得到相应的套路,
所以雪球老师才会带着大家复现很多生信文章,还把生信文章分为几大套路,比如:单基因生信套路、非肿瘤文章套路、ceRNA文章套路和泛癌文章套路等,
我会跟着雪球老师讲的内容把套路试着套在自己的idea上,看看是否可行,是否有科学意义;
5、然后就进行预实验,测试下自己的idea是否走得通;
6、正式实验:记录好参数、细节、软件、版本、数据来源等;
7、分析结果:我会想一下跑出来的数据结果要怎样展示,怎么展示才能明显表达出实验意义,怎样才能更漂亮;
8、最后就是写作投稿了,根据自己的潜在目标期刊来撰写文章,虽然我目前还没有投稿成功,但是我相信随着我学习的知识越来越多,终于有一天可以发表属于自己的生信sci滴~
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