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NEJM:每25人中就有1人携带与寿命缩短有关的基因型

NEJM:每25人中就有1人携带与寿命缩短有关的基因型

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由于技术的进步和成本的降低,外显子组和基因组测序的数量正在迅速增加。除了外显子组和基因组测序的临床背景外,涉及外显子组和基因组测序的研究计划正在招募非常大的患者队列。英国生物样本库(UK Biobank)研究中50万参与者的外显子组或基因组测序数据已经获得,而All of Us和Our Future Health项目正计划分别对100万和500万参与者进行测序。这些项目生成的数据将包括参与者携带的致病基因型。
2021年5月,美国医学遗传学和基因组学学会(ACMG)推出了与心血管、癌症和代谢等疾病相关的73个基因的可操作基因型,这些基因型可采取预防或治疗措施。2023年6月,ACMG发布了更新版本。但目前还缺乏这些基因中可操作基因型与寿命关联的评估。
2023年11月9日,deCODE公司安进旗下公司)的研究人员在《新英格兰医学杂志(NEJM)发表了题为Actionable Genotypes and Their Association with Life Span in Iceland 的研究论文。
该研究显示,4.05%的冰岛人携带了ACMG指南中的一个或多个可操作基因型,这些基因型引起的疾病包括心血管疾病、癌症和代谢疾病。携带这些可操作基因型的人比非携带者寿命更短在癌症易感基因型的携带者中观察到最大的影响,他们的中位生存期比非携带者短4年。
由于向人群提供精准医疗需要相当多的人群基因组学、转录组学和蛋白质组学数据,而冰岛人特别适合这项工作,因为位于冰岛的deCODE公司(安进旗下公司)此前已经积累了大量冰岛人群的此类数据。
在这项研究中,研究团队重点关注了那些增加疾病风险的基因型,这些疾病的预防或治疗措施已经建立,这些基因型被称为可操作基因型(actionable genotypes)。研究团队使用了一个基于人群的数据集(包括约5.8万名全基因组测序的冰岛人),以评估携带可操作基因型的个体比例。
利用美国医学遗传学和基因组学学会(ACMG)指南中列出的73个可操作基因(actionable genes),该研究发现,4.05%的冰岛人携带了这些基因中的一个或多个可操作基因型,这些基因型引起的疾病包括心血管疾病、癌症和代谢疾病。
该研究还评估了可操作基因型与其携带者寿命之间的关系。在癌症易感基因型的携带者中观察到最大的影响,他们的中位生存期比非携带者短4年。例如,携带BRCA2基因的致病突变的人易患乳腺癌、卵巢癌和胰腺癌,他们的寿命相比非携带者缩短了7年,而携带LDLR突变会导致高胆固醇和心血管疾病,他们的寿命相比非携带者缩短了6年。
论文通讯作者、deCODE公司科学家 Patrick Sulem 表示,这项研究中发现的可操作基因型,都被预测会导致严重疾病,可能会对寿命产生巨大影响。
该研究显示,每25人中就有1人(4%)携带一种可操作基因型,这导致了他们平均寿命的缩短。特定可操作基因型的携带者更有可能死于这些基因型引起的疾病。携带BRCA2基因致病突变的人,死于乳腺癌、卵巢癌或胰腺癌的风险是正常人的7倍。此外,他们患上前列腺癌的可能性是正常人的3.5倍,死于前列腺癌的可能性是正常人的7倍。
deCODE公司首席执行官 Kari Stefansson 表示,对参与者的可操作基因型的识别和披露可以指导临床决策,这可能会改善患者的结局。因此,这些发现具有减轻个人和整个社会的疾病负担的巨大潜力。

论文链接:https://www.nejm.org/doi/10.1056/NEJMoa2300792

来源:生物世界

            

   




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