由于技术的进步和成本的降低,外显子组和基因组测序的数量正在迅速增加。除了外显子组和基因组测序的临床背景外,涉及外显子组和基因组测序的研究计划正在招募非常大的患者队列。英国生物样本库(UK Biobank)研究中50万参与者的外显子组或基因组测序数据已经获得,而All of Us和Our Future Health项目正计划分别对100万和500万参与者进行测序。这些项目生成的数据将包括参与者携带的致病基因型。2021年5月,美国医学遗传学和基因组学学会(ACMG)推出了与心血管、癌症和代谢等疾病相关的73个基因的可操作基因型,这些基因型可采取预防或治疗措施。2023年6月,ACMG发布了更新版本。但目前还缺乏这些基因中可操作基因型与寿命关联的评估。2023年11月9日,deCODE公司(安进旗下公司)的研究人员在《新英格兰医学杂志》(NEJM)发表了题为:Actionable Genotypes and Their Association with Life Span in Iceland 的研究论文。该研究显示,4.05%的冰岛人携带了ACMG指南中的一个或多个可操作基因型,这些基因型引起的疾病包括心血管疾病、癌症和代谢疾病。携带这些可操作基因型的人比非携带者寿命更短,在癌症易感基因型的携带者中观察到最大的影响,他们的中位生存期比非携带者短4年。由于向人群提供精准医疗需要相当多的人群基因组学、转录组学和蛋白质组学数据,而冰岛人特别适合这项工作,因为位于冰岛的deCODE公司(安进旗下公司)此前已经积累了大量冰岛人群的此类数据。在这项研究中,研究团队重点关注了那些增加疾病风险的基因型,这些疾病的预防或治疗措施已经建立,这些基因型被称为可操作基因型(actionable genotypes)。研究团队使用了一个基于人群的数据集(包括约5.8万名全基因组测序的冰岛人),以评估携带可操作基因型的个体比例。利用美国医学遗传学和基因组学学会(ACMG)指南中列出的73个可操作基因(actionable genes),该研究发现,4.05%的冰岛人携带了这些基因中的一个或多个可操作基因型,这些基因型引起的疾病包括心血管疾病、癌症和代谢疾病。该研究还评估了可操作基因型与其携带者寿命之间的关系。在癌症易感基因型的携带者中观察到最大的影响,他们的中位生存期比非携带者短4年。例如,携带BRCA2基因的致病突变的人易患乳腺癌、卵巢癌和胰腺癌,他们的寿命相比非携带者缩短了7年,而携带LDLR突变会导致高胆固醇和心血管疾病,他们的寿命相比非携带者缩短了6年。论文通讯作者、deCODE公司科学家 Patrick Sulem 表示,这项研究中发现的可操作基因型,都被预测会导致严重疾病,可能会对寿命产生巨大影响。该研究显示,每25人中就有1人(4%)携带一种可操作基因型,这导致了他们平均寿命的缩短。特定可操作基因型的携带者更有可能死于这些基因型引起的疾病。携带BRCA2基因致病突变的人,死于乳腺癌、卵巢癌或胰腺癌的风险是正常人的7倍。此外,他们患上前列腺癌的可能性是正常人的3.5倍,死于前列腺癌的可能性是正常人的7倍。deCODE公司首席执行官 Kari Stefansson 表示,对参与者的可操作基因型的识别和披露可以指导临床决策,这可能会改善患者的结局。因此,这些发现具有减轻个人和整个社会的疾病负担的巨大潜力。论文链接:https://www.nejm.org/doi/10.1056/NEJMoa2300792
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