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针对南非Omicron BA.4/5流行病学研究提示:引起新冠病毒突变的宿主库可能持续存在

针对南非Omicron BA.4/5流行病学研究提示:引起新冠病毒突变的宿主库可能持续存在

科学

用数据,来辨清事实。



关键词:COVID-19;Akiko Iwasaki;疫情;疫苗


导言:


2022年6月27日Nature Med发表了一篇十分重要的BA.4/5在南非早期流行的分子流行学文章,这项研究来自南非Stellenbosch大学,该机构于去年12月最早报道了Omicron的流行病学

一直在美国从事病毒研究和抗病毒新药/疫苗研发的王宇歌博士对这篇文章做了解读;王博士特别分享了一些病毒进化方向的启示。


这篇文章的题目是“Emergence of SARS-CoV-2 Omicron lineages BA.4 and BA.5 in South Africa”。



最近BA.4/5正在欧洲造成最新的新一波新冠疫情,而这波疫情更早之前刚发生在了南非。



BA.4/5两者Spike(棘突蛋白)完全相同,因此研究中经常把BA.4和5作为一个亚型病毒进行研究。
与BA.2相比,BA.4/5增加了69-70del,L452R,F486V和Q493。69-70del使BA.4/5可以被SGFT PCR方法检测出来。



这项研究发现,在2022年4月,南非的BA.4/5取代了BA.2,占检出病例的50%以上。
应用多项逻辑回归(multinomial logistic regression model),研究发现BA.4/5的单日增长优势比BA.2高8%-10%。
作者因此认为南非涌现出的Beta,Omicron及BA.4/5说明引起病毒持续流行和变异的人类或者动物大型宿主库(reservoir)可能持续存在
简析:

BA.4/5的增长优势与Omicron对Delta的增长优势一样
,主要原因是由于新突变株形成了更强的免疫逃逸。
即新突变株可以突破之前感染/疫苗接种形成的免疫力造成重复感染/突破性感染,而不是Spike结合能力更强;相反,之前谢晓亮组发现BA.4/5因为回复突变实际上与受体结合能力更弱。
因此,Omicron新突变引入后,新的亚型不断取代旧的突变株,这一取代过程主要是因为Omicron引入新突变后形成新的突变株,而新的突变株可以突破旧突变株感染形成的中和抗体。

所以今后一段时间的病毒突变株可能依然会是
Omicron的新亚型
另外,目前没有证据证明BA.4/5引起的疾病更严重,晓亮组也证明BA.4/5与受体结合能力更弱。

小结:
新的突变株之所以成为新的主流毒株,主要是由于其免疫逃逸。
引起病毒持续流行和变异的人类或者动物大型宿主库可能持续存在。
今后一段时间的病毒突变株可能依然会是Omicron的新亚型。

原文链接:
【1】 https://www.nature.com/articles/s41591-022-01911-2


本期编辑Henry,微信号healsan。
Hanson临床科研团队,由6位在美国的医生及医学科学家组成;目前在美国主要从事新药研发和临床科研。
作者:王宇歌 博士,一直在美国从事病毒新药和疫苗研发。微博:子陵在听歌。
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