自噬 2022丨论文数量10年涨四倍，基金资助势头不减；无创检测或成转化亮点，研究的疾病全面开花
Bringing medical advances from the lab to the clinic.
（只要有SCI论文，就可以全家获得美国绿卡）
2，美国国立卫生研究院基金资助
美国目前专门用于自噬研究的课题达10,656项。从2011的452项，一直到2021年的1097项；且最近四年均保持在每年1000项以上的资助数量。
(美国国立卫生研究院基金资助的时间分布和项目数量）
*缺陷大分子、细胞器的细胞内清除，对细胞的长寿、组织的发育和分化很重要，主要包括两种情况：细胞内基础水平的固有存在的自噬（例如，神经元中的管家功能），和依赖于溶酶体活性的、选择性靶标药物诱导的自噬（靶标如受损细胞器、入侵细菌——线粒体自噬、铁蛋白自噬、内质网自噬、细菌/异体自噬）。
（自噬研究的简要时间线。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29686264/）
*癌症：包括乳腺癌、胰腺癌、胶质母细胞瘤、多发性骨髓瘤、黑色素瘤等，在不同肿瘤的不同情况中，自噬对疾病的影响机制各不相同。
*自身免疫性疾病：包括克罗恩病、SLE、肾小球肾炎；此时常见的机制之一是，自噬异常引起巨噬细胞释放促炎细胞因子增加，潘氏细胞颗粒分泌减少，沙门氏菌感染易感性增加，T细胞免疫失调。
（自噬的三种膜动力学。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29686264/）
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33053285/）
精选文献思路速览：
■ 针对癌症中的自噬：癌症发现的最新进展和未来方向 [18]
■ 自噬在肿瘤转移中的多效性作用 [16]
■ 肿瘤免疫治疗中的自噬、铁死亡、焦亡和坏死性凋亡。 [9]
■ circROBO1/KLF5/FUS反馈回路通过抑制afadin的选择性自噬调节乳腺癌肝转移。[1]
■ NUPR1通过激活TFE3依赖性自噬促进口腔鳞状细胞癌细胞的增殖和转移。[2]
■ 在胰腺癌中，IGF1R 和 MAPK/ERK 双重抑制增强了对自噬抑制的敏感性自噬 [10]
■ 同时抑制 IGF1R 和 ERK 增加胰腺癌对自噬抑制剂的敏感性[11]
■ 通过自噬抑制、MEK 阻断和 CD40 激动激活胰腺导管腺癌的免疫识别。[3]
■ 基质成纤维细胞中的自噬促进肿瘤结缔组织形成和乳腺肿瘤发生 [13]
■ 胶质母细胞瘤中的癌细胞自噬、重编程巨噬细胞和重构的脉管系统触发肿瘤免疫。 [4]
■ METTL3 介导的 ATG7 的 m6A 修饰调节自噬-GATA4 轴以促进细胞衰老和骨关节炎进展。[5]
■ 胎儿发育不全的肺中受到自噬的损害，并通过给予羊水干细胞胞外囊泡来挽救。[6]
■ 自噬的无创检测。[7]
■ FGF21 通过TFEB 介导的自噬增强和抗氧化反应减轻肢体缺血/再灌注损伤后的微血管损伤。[8]
■ 核糖体分析揭示了自噬在 mRNA 翻译控制中的功能性作用 [17]
■ 溶酶体抑制期间的分泌性自噬 (SALI) [12]
■ 自噬机制在细胞外囊泡生物发生和分泌中的新作用 [14]
■ NRF2 在抑制自噬时激活巨胞饮作用 [15]
检索工具：文献鸟/PubMed
检索时间：Octorber 23, 2022
检索及分析机构：Healsan Consulting LLC（美国恒祥咨询）; Stork（文献鸟）
检索词：autophagy[Title]
一，自噬研究论文大数据分析
自噬论文发表的时间和国家分布
时间分布显示，可以看到针对自噬的研究论文数量，2020年有3,268篇，2021年为4,104篇。
国家分布可以看到，中国发表的研究论文数量为6,630篇，占60.5%，位居第一；
美国发表的文章数占14.4%，排在第二位；
日本、意大利和印度分列第三到五位。
学术机构排名
浙江大学、中南大学、复旦大学、中山大学、四川大学等所在大学发表的论文最多。
华西医院、武汉大学人民医院、浙江大学第一附属医院、华中科技大学同济医学院同济医院、温州医科大学附属第二医院（育英儿童医院）等是发表论文最多的医院。
研究热点基因和相关疾病
自噬研究也涉及 胰腺癌、骨关节炎、前列腺癌、黑色素瘤、膀胱癌、卵巢癌、中风、结核、脂肪肝、糖尿病、肝病、脊髓损伤 等疾病。
哪些期刊喜欢自噬研究？
可以看到发表自噬相关研究最多的五个杂志是 Autophagy (IF=13.4)、 Int J Mol Sci (IF=6.2)、 Front Pharmacol (IF=6)、 Cell Death Dis (IF=9.7)、 Cells (IF=7.7)等。
我们也附上部分期刊的影响因子、分区、从投稿到接受的天数等，对于投稿有非常重要的参考价值。
最有影响力学者及其关系网。
国际自噬研究论文中
最有影响力的学者。
（学术大咖及其关系网。）
学者影响力是基于
学者在该领域的论文影响因子总分。
二，自噬研究领域
的经典论文
所以我们通过大数据分析找到高引用论文，即领域内的经典论文。
Wang Z, et al. The circROBO1/KLF5/FUS feedback loop regulates the liver metastasis of breast cancer by inhibiting the selective autophagy of afadin. Mol Cancer. 2022 Jan 24;21(1):29. doi: 10.1186/s12943-022-01498-9. PMID: 35073911; PMCID: PMC8785480.[1] Fan T, et al. NUPR1 promotes the proliferation and metastasis of oral squamous cell carcinoma cells by activating TFE3-dependent autophagy. Signal Transduct Target Ther. 2022 Apr 25;7(1):130. doi: 10.1038/s41392-022-00939-7. Erratum in: Signal Transduct Target Ther. 2022 Sep 16;7(1):321. PMID: 35462576; PMCID: PMC9035452.[2] Jiang H, et al. Activating Immune Recognition in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma via Autophagy Inhibition, MEK Blockade, and CD40 Agonism. Gastroenterology. 2022 Feb;162(2):590-603.e14. doi: 10.1053/j.gastro.2021.09.066. Epub 2021 Oct 8. Erratum in: Gastroenterology. 2022 Feb 7;: PMID: 34627860.[3] Chryplewicz , et al. Cancer cell autophagy, reprogrammed macrophages, and remodeled vasculature in glioblastoma triggers tumor immunity. Cancer Cell. 2022 Oct 10;40(10):1111-1127.e9. doi: 10.1016/j.ccell.2022.08.014. Epub 2022 Sep 15. PMID: 36113478; PMCID: PMC9580613.[4] Chen X, et al. METTL3-mediated m6A modification of ATG7 regulates autophagy-GATA4 axis to promote cellular senescence and osteoarthritis progression. Ann Rheum Dis. 2022 Jan;81(1):87-99. doi: 10.1136/annrheumdis-2021-221091. Epub 2021 Oct 27. PMID: 34706873.[5]
Khalaj K, et al. Autophagy Is Impaired in Fetal Hypoplastic Lungs and Rescued by Administration of Amniotic Fluid Stem Cell Extracellular Vesicles. Am J Respir Crit Care Med. 2022 Aug 15;206(4):476-487. doi: 10.1164/rccm.202109-2168OC. PMID: 35671495.[6] Loos B, et al. Non-invasive monitoring of autophagy. Nat Biomed Eng. 2022 Sep;6(9):1015-1016. doi: 10.1038/s41551-022-00943-w. PMID: 36127452.[7] Chen F, et al. FGF21 alleviates microvascular damage following limb ischemia/reperfusion injury by TFEB-mediated autophagy enhancement and anti-oxidative response. Signal Transduct Target Ther. 2022 Oct 12;7(1):349. doi: 10.1038/s41392-022-01172-y. PMID: 36220813; PMCID: PMC9553877.[8] Gao W,et al. Autophagy, ferroptosis, pyroptosis, and necroptosis in tumor immunotherapy. Signal Transduct Target Ther. 2022 Jun 20;7(1):196. doi: 10.1038/s41392-022-010. [9]
三，如何开启自己的
自噬研究
除了前面内容，您已经深信不疑的是：自噬研究很值得做。尤其是研究生选题，可能这是一辈子课题的好起点。
A，基础研究：
在研基金
比如ST. JUDE CHILDREN'S RESEARCH HOSPITAL的Green, Douglas R目前在研的3项课题，专注于细胞死亡的机制研究，包括自噬蛋白的非经典功能：
Non-canonical functions of autophagy proteins
发表的论文
(2022) Susceptibility to autophagy inhibition is enhanced by dual IGF1R and MAPK/ERK inhibition in pancreatic cancer Autophagy [10]
(2022) Concurrent Inhibition of IGF1R and ERK Increases Pancreatic Cancer Sensitivity to Autophagy Inhibitors Cancer research [11]
B，转化医学：
在研基金
如UNIVERSITY OF CALIFORNIA, SAN FRANCISCO的Debnath, Jayanta目前在研的3项课题，专注于肿瘤细胞中的自噬相关机制，尤其是肿瘤细胞的转移与分化：
2)Stromal Fibroblast Autophagy In Tumor Progression and Desmoplasia
3)Endolysosomal defects in secretory autophagy and microglial toxicity in FTD
发表的论文
如UNIVERSITY OF CALIFORNIA, SAN FRANCISCO的Debnath, Jayanta，
(2022) Secretory autophagy during lysosome inhibition (SALI) Autophagy [12] (2021) Autophagy in stromal fibroblasts promotes tumor desmoplasia and mammary tumorigenesis Genes & development [13] (2021) Emerging roles for the autophagy machinery in extracellular vesicle biogenesis and secretion FASEB bioAdvances [14] (2021) NRF2 activates macropinocytosis upon autophagy inhibition Cancer cell [15] (2021) The pleiotropic functions of autophagy in metastasis Journal of cell science [16] (2020) Ribosome profiling reveals a functional role for autophagy in mRNA translational control Communications biology [17] (2019) Targeting Autophagy in Cancer: Recent Advances and Future Directions Cancer discovery [18]
Hanson解读：
通过针对自噬论文的大数据分析，我们可以快速了解该领域研究的总体势态、研究热点、重要机构、突出学者、经典论文及这些论文发表的期刊分布。
1）自噬研究，目前是医生科学家最好的切入时机。一方面，自噬的机制已经比较清楚；另一方面，目前针对自噬在不同病理状态下的激活/抑制干预效果研究还远远不够。
2）针对自噬研究，目前发表了33,156篇Medline论文，且论文数量快速增长。且有非常高的比例发表在高质量期刊上。
发文最多期刊是Autophagy (IF=13.4)、 Int J Mol Sci (IF=6.2)、 Front Pharmacol (IF=6)、 Cell Death Dis (IF=9.7)、 Cells (IF=7.7)等。有19.4%的研究发表在影响因子大于9分的期刊,2.0发表在24分以上期刊。
3）自噬研究领域广泛，除了感染、炎症和癌症等先天免疫反应相关疾病以外，在代谢疾病等领域都有研究开展。
4）针对自噬研究最有影响力的论文，已经由机制探索、细胞和动物实验，转向临床转化和研发。
5）由于我们的专业知识所限，本大数据分析可能存在误差；且仅为学术交流用，不用于任何排名或者比较。也期待各位专家点评及提出改进意见。
6）更多研究靶点分析报告，在本公众号主页面下回复“靶点”查看；如回复“肿瘤科”或“外泌体”，获得对应研究领域推送资料。
既往相关推文：
编辑：Henry，微信号：Healsan。
作者简介：美国Healsan Consulting(恒祥咨询)，专长于医学生物大数据分析、临床科研设计和SCI论文深度润色；并提供上述服务，包括针对您课题的大数据分析。
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