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T​细胞耗竭研究2023,Nature引领,在癌症、感染、自身免疫等领域频频突破

T​细胞耗竭研究2023,Nature引领,在癌症、感染、自身免疫等领域频频突破

科学

 让科研和SCI论文成为临床工作的副产品。


关键词:T细胞耗竭;免疫疗法;基金;临床科研

导言


2023年9月23日,Nature杂志发表了美国学者一篇题为“The β1-adrenergic receptor links sympathetic nerves to T cell exhaustion”的文章【1】,首次揭示了杀伤性 T 细胞耗竭与人体交感神经(“战斗或逃跑”)应激反应之间的关系;研究进一步表明,β受体阻滞剂这类常用药物可以抑制这些CD8 + T细胞和与ADRB1受体结合的交感应激反应激素之间的相互作用,使杀伤性T细胞能够更有效地对抗肿瘤。

Nature丨揭示β 受体阻滞剂加强抗癌疗效的机制。延伸,你可快速发出高质量研究论文;还有更多课题在路上

(如果需原文,可与微信号“HealsanQ”联系索取;备注“20231123”)

我们进一步检索显示,T细胞耗竭研究成果16.5%发表在12分+期刊为辅助课题选题及国自然基金撰写,本期解读“T细胞耗竭”相关的研究大数据分析。

T细胞衰竭是一种功能减退状态, 是指在抗原持续暴露的情况下,由于TCR被持续刺激,导致T细胞效应功能和自我更新能力进行性下降。

在过去的一年里,T细胞耗竭的研究热度持续攀升,成基金资助和SCI期刊的宠儿;研究的突出成果包括:
A,T细胞耗竭抗肿瘤相关的临床研究进展;
B,T细胞耗竭在感染、高应激生理病理状态下的研究进展;
C,T细胞耗竭抗肿瘤相关的机制研究进展。

1,美国国立卫生研究院基金资助
美国目前专门用于T细胞耗竭研究的课题有3,032项。从2012的68项,一直到2023年的445项。
(美国国立卫生研究院基金资助的时间分布和项目数量

2,论文质量和增速
到2023年11月15日,T细胞耗竭研究领域已经发表了7,561篇PubMed收录的论文。从2012年161篇论文,2023年到目前已经发表了1,223篇论文;论文发表数量增速堪比火箭。

(T细胞耗竭研究发表的期刊分布及时间分布)

为了解目前在T细胞耗竭领域的研究进展,我们对发表的论文做了全面解读。
精选文献思路速览:


1)T细胞耗竭抗肿瘤相关的临床研究进展; 2)T细胞耗竭在感染、高应激生理病理状态下的研究进展; 3)T细胞耗竭抗肿瘤相关的机制研究进展:

1)T细胞耗竭抗肿瘤相关的临床研究进展
■ 难治性黑色素瘤的多器官景观 [3]

■ Relatlimab 和 Nivolumab 与 Nivolumab 治疗未经治疗的晚期黑色素瘤 [2]
■ 免疫检查点抑制剂治疗伴有慢性淋巴细胞白血病患者的晚期黑色素瘤的疗效 [8]
■ 预先存在的 T 细胞景观决定了多发性骨髓瘤患者对双特异性 T 细胞接合的反应 [9]

■ 人局部淋巴结对癌症免疫治疗的动态 CD8+ T 细胞反应在淋巴结转移中被破坏 [4]

■ 帕博利珠单抗用于 CD19 定向 CAR T 细胞治疗后复发或难治的 B 细胞淋巴瘤。[26]
2)T细胞耗竭在感染、高应激生理病理状态下的研究进展

■ NFAT 依赖性和不依赖性衰竭回路在妊娠期间对母体 CD8 T 细胞功能减退进行编程。[25]
■ MicroRNA-29a 在慢性感染期间减弱 CD8 T 细胞耗竭并诱导记忆样 CD8 T 细胞 [24]

■ MARCH1 控制促进过敏性气道炎症的效应 CD4 T 细胞的衰竭样程序。[12]

■ 疲劳相关的胆固醇缺乏会抑制抗肿瘤免疫的细胞毒性臂 [10]

3)T细胞耗竭抗肿瘤相关的机制研究进展

■ T细胞耗竭对癌症免疫治疗的临床意义 [7]

■  T 细胞耗竭的不同克隆分化轨迹。[11]

■ T 细胞耗竭的全基因组 CRISPR 筛选可识别限制 T 细胞持久性的染色质重塑因子。[13]
■ T 细胞耗竭的表观遗传调控。[14]

■ STAT5A 在 CD8+ T 细胞耗竭中拮抗 TOX [1]

■ β1-肾上腺素能受体将交感神经与T细胞衰竭联系起来 [5]
■ 癌症中的Y染色体丢失通过逃避适应性免疫来驱动生长 [6]
■ 癌症中巨噬细胞与耗竭的 CD8 T 细胞之间的时空共依赖性。[15]
■ 增强蛋白酶调节的CAR-T细胞受体的安全性和有效性。[16]
■ 人类CAR T细胞耗竭的动态染色质调控图景。[17]
■ 瞬时休息通过表观遗传重塑恢复耗竭的CAR-T细胞的功能。[18]
■ 癌症免疫周期中的CD8 T细胞。[19]
■ CD8 T 细胞耗竭的体外建模使 CRISPR 筛选能够揭示 BHLHE40 的作用。[20]
■    假激酶 Trib1 调节耗竭的 T 细胞向 KLR 状态的转变,其缺失改善了检查点阻断。[21]
■    SWI/SNF 染色质重塑复合物 BAF 和 PBAF 差异调节耗竭 CD8 T 细胞中的表观遗传转化。  [22]
■ 核定位在耗竭的 CD8 T 细胞中 T-bet 和 Eomes 的调节和功能中的作用。[27]
■ 自身反应性 CD8 T 细胞受到 LAG3 维持的衰竭样程序的约束。[23]

检索数据库:Medline
检索工具:Healsan™医学大数据
检索时间:November 19, 2023
检索及分析机构:Healsan Consulting LLC(美国恒祥咨询)


一,T细胞耗竭研究论文大数据分析
T细胞耗竭研究
论文发表的时间和国家分布

检索最近三年的数据,得到1,270篇,对其进行分析。
时间分布显示,可以看到针对T细胞耗竭的研究论文数量,2021年仅有2,393篇,2023年至今为4,135篇。
国家分布可以看到,中国发表的研究论文数量为468篇,占36.9%,位居第一
美国发表的文章数占31.5%
,排在第二位;国、日本意大利分列第三到五位。


(SCI论文的时间和国家分布)

学术机构排名
斯坦福大学、加州大学旧金山分校、德克萨斯大学MD安德森癌症中心、宾夕法尼亚大学、上海交通大学医学院所在大学发表的论文最多。
德克萨斯大学MD安德森癌症中心、纪念斯隆凯特琳癌症中心、马萨诸塞州总医院、中山医院南京医科大学附属第一医院(江苏省人民医院)等是发表论文最多的医院。

(全球发表论文的机构排名)
研究热点基因相关疾病

如下图所示,显示TIGIT、TOX、EOMES、BATF、CD38等是T细胞耗竭研究中最受关注的基因。
1)TIGIT(T细胞免疫受体与免疫球蛋白和ITIM结构域):
TIGIT是一种抑制性免疫检查点受体,表达在活化的T细胞和自然杀伤(NK)细胞上。TIGIT通过与其配体PVR相互作用,传递抑制性信号,从而降低T细胞的活性和增殖能力。在癌症和慢性感染中,TIGIT的过度表达与T细胞功能的减弱相关。
2)TOX(胸腺原性高度表达的核转录因子):
TOX是一种转录因子,关键作用于T细胞的分化和耗竭。在慢性感染和肿瘤微环境中,TOX的表达上调,导致T细胞持续激活和耗竭。TOX通过调控相关基因表达,影响T细胞的功能和寿命。
3)EOMES(eomesodermin):
EOMES是一种T-box转录因子,与T细胞的分化和效应功能密切相关。在某些情况下,EOMES的表达与T细胞耗竭相关,特别是在慢性病毒感染和癌症中。EOMES可能通过调控细胞因子产生和细胞毒性功能来影响T细胞的效应。
4)BATF(基本亲和力转录因子):
BATF属于AP-1转录因子家族,对T细胞的分化和功能具有重要作用。BATF在T细胞激活和分化过程中调控细胞因子的表达,其表达水平的改变可能影响T细胞的反应能力和耗竭状态。
5)CD38:
CD38是一种表面分子,参与钙信号传递和细胞激活。在T细胞耗竭中,CD38的表达增加,与细胞的激活状态和代谢紊乱有关。CD38作为T细胞激活的标志,可能反映了细胞的耗竭和功能衰减。

T细胞耗竭研究也涉及(多发性)黑色素瘤、SARS-CoV-2、膀胱癌、胰腺癌、败血症、胃癌、肠癌、卵巢癌等治疗方案与疾病。
(T细胞耗竭研究相关的基因和疾病) 

哪些期刊喜欢T细胞耗竭研究?

可以看到发表T细胞耗竭相关研究最多的五个杂志是Front Immunol (IF=7.3)、Front Oncol (IF=4.7)、J Immunother Cancer (IF=10.9)、Nat Commun (IF=16.6)、Cancers Basel (IF=5.2)等。
(发表论文的杂志分布)

我们也附上部分期刊的影响因子、分区、从投稿到接受的天数等,对于投稿有非常重要的参考价值。


最有影响力学者及其关系网。

(学术大咖及其关系网。)

国际T细胞耗竭研究论文中
最有影响力的学者。

其中德克萨斯大学安德森癌症中心的Tawbi, Hussein A; 斯坦福大学的Satpathy, Ansuman T; 南安普敦大学医学院(英国)的Elliott, Tim; 宾夕法尼亚大学的Wherry, E John; 索尔克生物研究所(美国)的Globig, Annamaria等T细胞耗竭研究领域最为活跃的学者

二,T细胞耗竭研究领域
的经典论文

除了发表论文的数量和研究者论文影响力之外(数量+质量),单篇论文被引用次数是评价其学术影响力的重要指标。
所以我们通过大数据分析找到高引用论文,即领域内的经典论文。
高影响力的5篇SCI论文依次为
• Arcia-Anaya et al. STAT5A antagonizes TOX in CD8+ T cell exhaustion; Nat Rev Immunol. 2023 PubMed ID:  36596846 [1]
• Tawbi et al. Relatlimab and Nivolumab versus Nivolumab in Untreated Advanced Melanoma; N Engl J Med. 2022 PubMed ID:  34986285 [2]
• Liu et al. Multi-organ landscape of therapy-resistant melanoma; Nat Med. 2023 PubMed ID:  37106167 [3]
• Rahim et al. Dynamic CD8+ T cell responses to cancer immunotherapy in human regional lymph nodes are disrupted in metastatic lymph nodes; Cell. 2023 PubMed ID:  36931243 [4]
• Globig et al. The β1-adrenergic receptor links sympathetic nerves to T cell exhaustion; Nature. 2023 PubMed ID:  37731001 [5]

近2年最高引用的5篇论文依次为(删除了与上一部分重复的五篇)
• Abdel-Hafiz et al. Y chromosome loss in cancer drives growth by evasion of adaptive immunity; Nature. 2023 PubMed ID:  37344596 [6]
• Chow et al. Clinical implications of T cell exhaustion for cancer immunotherapy; Nat Rev Clin Oncol. 2022 PubMed ID:  36216928 [7]
• Cass et al. Efficacy of immune checkpoint inhibitors for the treatment of advanced melanoma in patients with concomitant chronic lymphocytic leukemia; Ann Oncol. 2023 PubMed ID:  37414216 [8]
• Friedrich et al. The pre-existing T cell landscape determines the response to bispecific T cell engagers in multiple myeloma patients; Cancer Cell. 2023 PubMed ID:  36898378 [9]
• Yan et al. Exhaustion-associated cholesterol deficiency dampens the cytotoxic arm of antitumor immunity; Cancer Cell. 2023 PubMed ID:  37244259 [10]

三,如何开启自己的
T细胞耗竭研究

看了前面内容,您已经深信不疑的是:T细胞耗竭研究很值得做。尤其是研究生选题,可能这是一辈子课题的好起点。
 
问题是:如何开始呢?
最简单的方法:从模仿,到超越。
在研基金
如斯坦福大学的Satpathy, Ansuman T目前在研的课题,主要专注于癌症中的T 细胞耗竭相关机制,举例有:

发表的论文
如斯坦福大学的Satpathy, Ansuman T
  1. (2022) Divergent clonal differentiation trajectories of T cell exhaustion. Nat Immunol. [11]
  2. (2022) MARCH1 Controls an Exhaustion-like Program of Effector CD4 T Cells Promoting Allergic Airway Inflammation. Immunohorizons. [12]
  3. (2022) Genome-wide CRISPR screens of T cell exhaustion identify chromatin remodeling factors that limit T cell persistence. Cancer Cell. [13]
  4. (2022) Epigenetic regulation of T cell exhaustion. Nat Immunol. [14]
  5. (2022) Spatiotemporal co-dependency between macrophages and exhausted CD8 T cells in cancer. Cancer Cell. [15]
  6. (2022) Enhanced safety and efficacy of protease-regulated CAR-T cell receptors. Cell. [16]
  7. (2022) Dynamic chromatin regulatory landscape of human CAR T cell exhaustion. Proc Natl Acad Sci U S A.  [17]
  8. (2021) Transient rest restores functionality in exhausted CAR-T cells through epigenetic remodeling. Science. [18]

B,转化医学:
在研基金
如宾夕法尼亚大学的Wherry, E John目前在研的课题,主要专注于抗病毒免疫1型糖尿病免疫细胞的T细胞耗竭相关机制,举例有:

发表的论文
如宾夕法尼亚大学的Wherry, E John,
  1. (2023) CD8 T cells in the cancer-immunity cycle. Immunity. [19]
  2. (2023) In vitro modeling of CD8 T cell exhaustion enables CRISPR screening to reveal a role for BHLHE40. Sci Immunol.  [20]
  3. (2023)The pseudokinase Trib1 regulates the transition of exhausted T cells to a KLR state, and its deletion improves checkpoint blockade. Cell Rep. [21]
  4. (2023) The SWI/SNF chromatin remodeling complexes BAF and PBAF differentially regulate epigenetic transitions in exhausted CD8 T cells. Immunity. [22]
  5. (2022) Divergent clonal differentiation trajectories of T cell exhaustion. Nat Immunol. [11]
  6. (2022) Autoreactive CD8 T cells are restrained by an exhaustion-like program that is maintained by LAG3. Nat Immunol. [23]
  7. (2022) MicroRNA-29a attenuates CD8 T cell exhaustion and induces memory-like CD8 T cells during chronic infection. Proc Natl Acad Sci U S A. [24]
  8. (2022) NFAT-dependent and -independent exhaustion circuits program maternal CD8 T cell hypofunction in pregnancy. J Exp Med. [25]
  9. (2022) Pembrolizumab for B-cell lymphomas relapsing after or refractory to CD19-directed CAR T-cell therapy. Blood. [26]
  10. (2021) Role of nuclear localization in the regulation and function of T-bet and Eomes in exhausted CD8 T cells. Cell Rep. [27]

C,美国在研基金的方向

(美国目前在研的T细胞耗竭方向)

美国的部分在研T细胞耗竭课题

更多大数据分析报告,在本公众号主页面下回复“大数据”查看;如回复“肿瘤科”或“T细胞耗竭”,获得对应研究领域推送资料。


编辑Henry,微信号:Healsan;加好友请注明理由。
助理:ChatGPT;封面:Hanson设计、DALL·E制图
美国Healsan Consulting(恒祥咨询),专长于Healsan医学大数据分析(Healsan™)、及基于大数据的Hanson临床科研培训(HansonCR™)和医学编辑服务(MedEditing™)。主要为医生科学家、生物制药公司和医院科研处等提供分析和报告,成为诸多机构的“临床科研外挂”。

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